És l'òrgan executiu d’Arxivers sense Fronteres. Els seus membres són elegits per un període de quatre anys amb possibilitat de ser reelegits.
Les seves funcions principals són, entre altres:
Composició
D’acord amb els estatuts de l’entitat formen part de la Junta Directiva el president/a, el vicepresident/a, el secretari/a, el tresorer/a i els vocals. Aquests càrrecs han de ser exercits per persones diferents.
Convocatòria de reunions
Les sessions de la Junta Directiva són convocades pel president/a i es reuneixen, com a norma general, un cop al mes.